AGLAE est un accélérateur électrostatique de 2 millions de volts de type tandem, équipé de deux sources d'ions, l'une pour la production de protons et de deutons, et l'autre pour celle de particules alpha. Deux lignes expérimentales sont actuellement en service, l'une classique conduisant à une chambre à vide et l'autre dénommée ligne de faisceau extraite à l'air, spécialement conçue pour l'analyse directe des œuvres d'art sans prélèvement. Cette ligne a été récemment équipée d'un dispositif de focalisation qui permet de réduire la taille du faisceau jusqu'à environ 10 µm et de réaliser ainsi une microsonde nucléaire à pression atmosphérique.